Ну у меня больше не падает.
Кстати, первый раз упало на стандартной теме. Начал менять я позже.
Помогало:
sudo killall nautilus
(повторять до полного излечения (иногда не с первого раза тема восстанавляивается))
У меня есть теория: вышло некоторое обновление, которое залепило дыру в наутилусе или в менеджере тем.