по пакетам:
сделайте dpkg --list, там увидите установленные пакеты. на всякие там gimp и прочие браузеры-плееры сделайте:
apt-get purge пакет пакет пакет
теперь по синку:
Перед втыканием смотрим ls /dev/sd*, запоминаем.
воткнули диск, загрузились, посмотрели /dev/sd*, заметили, что появился новый диск. Предположим, что это /dev/sdb
если на нём нет линуксовой ФС - разметили fdisk'ом и создали ФС. ВНИМАНИЕ - в этом случае старым данным придёт смерть:
fdisk /dev/sdb
там жмёте m - появится инструкция. создайте 2 раздела - один большой под корень и ещё один гига на 4 под своп.
записали таблицу на диск. Предположим, что вы сделали /dev/sdb1 под корень и /dev/sdb2 под своп.
mkfs.ext3 /dev/sdb1
mkswap /dev/sdb2
создаёте каталог под маунт - mkdir /mnt/disk
маунтите mount /dev/sdb1 /mnt/disk
даёте команды из пред.поста.
Всё в консоли от рута.
Ещё раз предупреждаю, чтобы были _очень_ внимательны при разметке и не убили оригинальный диск.