Была та же проблема, на том же дистрибутиве, при этом ещё и Alterator не запускался.
Можно сделать так:
# rpm -e libgtk+2 --nodeps
# rpm -e libgtk+2-common --nodeps
То есть удалить через установщик пакетов, причём без зависимостей (а иначе они за собой пол-системы утянут).
Потом перейти в каталог на диске, где лежат старые rpm-ки и либо скопировать их куда-то, либо прямо оттуда же в консоли через установщик пакетов поставить:
# rpm -i пакет1.rpm пакет2.rpm