От винта действительно тоже может быть, особенно если используется виртуальная память. Но я бы в первую очередь проверял оперативку и, как ни странно, охлаждение.
Другое дело, если сыпется только mplayer. Такое может быть, например, если некоторые его файлы были затёрты другими версиями. Здесь всё проще - переустановить mplayer.